RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 METRNLQ641Q3 311 aa16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.16■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 K7EQS6 105 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 PTOV1Q86YD1 416 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 H0Y8X5 98 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 ADH1BP00325 375 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 PIGAP37287 484 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 OR1E2P47887 323 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 VLDLRP98155 873 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 PIGFQ07326 219 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 KCNAB2Q13303 367 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 APOFQ13790 326 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 STARD8Q92502 1023 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 PTGES3LE9PB15 166 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 VILLO15195 856 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 EGFP01133 1207 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 RPN2P04844 631 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 MAPK12P53778 367 aa16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PKN3-201ENST00000291906 A0A1W2PRB8 838 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 NTSR1P30989 418 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 HSPB3Q12988 150 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 RGNQ15493 299 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 RNF130Q86XS8 419 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 GLOD5A6NK44 160 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 COL9A1P20849 921 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ESRRGP62508 458 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 MEP1AQ16819 746 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CEP68Q76N32 757 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ARL10Q8N8L6 244 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD53Q8N9V6 530 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 OR52J3Q8NH60 311 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SGCDQ92629 289 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 UBE2E3Q969T4 207 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.14■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 A0A087WXM4 84 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 POM121BA6NF01 834 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 GPX2P18283 190 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ARHGDIAP52565 204 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PPP2CBP62714 309 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PPP2CAP67775 309 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SERPINA11Q86U17 422 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SMYD1Q8NB12 490 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SMPDL3AQ92484 453 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 FCRL1Q96LA6 429 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CCR8P51685 355 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CLCA4Q14CN2 919 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ADRM1Q16186 407 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 LAS2Q8IYD9 372 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PGBD3Q8N328 593 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 PADI4Q9UM07 663 aa16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 FABP3P05413 133 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms