RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 CPNE8Q86YQ8 564 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 SLC15A3Q8IY34 581 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 ACDQ96AP0 544 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 HSH2DQ96JZ2 352 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 UPK3BL1B0FP48 263 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 UPK3BL2E5RIL1 263 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 ALG10BQ5I7T1 473 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 RNF130Q86XS8 419 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 CANT1Q8WVQ1 401 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 CGREF1Q99674 301 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 OR2T5Q6IEZ7 315 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 OR2T29Q8NH02 315 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 SEC14L1Q92503 715 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 ALPK1Q96QP1 1244 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 PTGES2Q9H7Z7 377 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 IL21RQ9HBE5 538 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED3-201ENST00000255198 PLATP00750 562 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 EDNRBP24530 442 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 GKP32189 559 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 PREPP48147 710 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TLE2Q04725 743 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 MAPK15Q8TD08 544 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SLC5A11Q8WWX8 675 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 USP29Q9HBJ7 922 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 M0QX08 132 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 MSL3P1P0C860 447 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TYRP14679 529 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 PRKACGP22612 351 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SOX2P48431 317 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM225Q6GV28 225 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 BRAT1Q6PJG6 821 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 IRF2BP1Q8IU81 584 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SMPDL3AQ92484 453 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 ASB3Q9Y575 518 aa19.83■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 OR2AP1Q8NGE2 309 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TDP1Q9NUW8 608 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 HIF3AQ9Y2N7 669 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CMAHPQ9Y471 501 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 HS3ST4Q9Y661 456 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM63AO94886 807 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SEC23BQ15437 767 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM74Q86UV6 250 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 PXYLP1Q8TE99 480 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TRAV6A0A075B6T7 132 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 FNTBP49356 437 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CRHR2Q13324 411 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 DPYSL2Q16555 572 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 NCEH1Q6PIU2 408 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 KCTD3Q9Y597 815 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 NPIPA2E9PIF3 369 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 NPIPA3F8WFD2 350 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SLC22A1O15245 554 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CFL1P23528 166 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TM4SF1P30408 202 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 E2F1Q01094 437 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 FAM86B1Q8N7N1 296 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 LRRC57Q8N9N7 239 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM74Q96NL1 305 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 HCN2Q9UL51 889 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 ABLIM1O14639 778 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 PBX1P40424 430 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 RHEBQ15382 184 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 TREML1Q86YW5 311 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 OR52B2Q96RD2 323 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 KCNA7Q96RP8 456 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 BCO2Q9BYV7 579 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 PIGVQ9NUD9 493 aa19.82■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SFTPBP07988 381 aa19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 HSD3B1P14060 373 aa19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 HMGN2P46Q86SG4 172 aa19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 OR56A1Q8NGH5 318 aa19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 AP1S3Q96PC3 154 aa19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 CYP8B1Q9UNU6 501 aa19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
ZBED3-201ENST00000255198 SCO2O43819 266 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms