RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237380.11

MED28-201, Transcript of mediator complex subunit 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MED28, Length 10,868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28-201ENST00000237380 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZNF33BQ06732 778 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CTBP1Q13363 440 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 OR7D4Q8NG98 312 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CDC6Q99741 560 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CITO14578 2027 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TIMP1P01033 207 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.266e-8■■□□□ 12.6
MED28-201ENST00000237380 XYLT1Q86Y38 959 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 SYT3Q9BQG1 590 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 RNF24Q9Y225 148 aa7.2□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 A0A1W2PRQ8 180 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 C5orf51A6NDU8 294 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 HSPA7P48741 367 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 BOD1Q96IK1 185 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 NID2Q14112 1375 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 BMI1P35226 326 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 LIMK2P53671 638 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 GNG2P59768 71 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 RAET1LQ5VY80 246 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 FRG2Q64ET8 278 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 GPR152Q8TDT2 470 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 FRG2BQ96QU4 278 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 MRI1Q9BV20 369 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 GGT3PA6NGU5 568 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 FGL1Q08830 312 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 SCARB2Q14108 478 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 NTRK3Q16288 839 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 USP30Q70CQ3 517 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 NDNFQ8TB73 568 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 FAM3CQ92520 227 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 LPGAT1Q92604 370 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 MND1Q9BWT6 205 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 MROQ9BYG7 248 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 COL20A1Q9P218 1284 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CD84Q9UIB8 345 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 LDB2O43679 373 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CD3GP09693 182 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ITGB5P18084 799 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ERVK-8P63133 956 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CYP4F8P98187 520 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 BEND4Q6ZU67 534 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZNF611Q8N823 705 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ALOX15BO15296 676 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 MSL3P1P0C860 447 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 IL32P24001 234 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 HOXC13P31276 330 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 XKP51811 444 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 GYS2P54840 703 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 OR2B6P58173 313 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 RING1Q06587 406 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ARSKQ6UWY0 536 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 ZNF570Q96NI8 536 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 TSSK3Q96PN8 268 aa7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MED28-201ENST00000237380 CENPMQ9NSP4 180 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms