RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 XKR8Q9H6D3 395 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 POT1Q9NUX5 634 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KLF15Q9UIH9 416 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 SNX7Q9UNH6 387 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0G2JNG1 304 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 DHRS12A0PJE2 317 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 METTL12A8MUP2 240 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 AKAP10O43572 662 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 SCELO95171 688 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 LRATO95237 230 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 FURINP09958 794 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 THEGLP0DJG4 465 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMP1P11279 417 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 FCGR1AP12314 374 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V1C1P21283 382 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CD27P26842 260 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CMPK1P30085 196 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 BSGP35613 385 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GRK3P35626 688 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 AHRP35869 848 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GRIA3P42263 894 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GZMMP51124 257 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 MTPNP58546 118 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 RELAQ04206 551 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ZP2Q05996 745 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ABHD18Q0P651 414 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 SELPLGQ14242 412 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 FZD2Q14332 565 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR2DS3Q14952 304 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR2DS5Q14953 304 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIP10Q15642 601 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 HKDC1Q2TB90 917 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PGS1Q32NB8 556 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GLYATQ6IB77 296 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 LILRA2Q8N149 483 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR156Q8NFN8 814 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 LCN9Q8WX39 176 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 NRTNQ99748 197 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 INPP5KQ9BT40 448 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 IER2Q9BTL4 223 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 DUSP26Q9BV47 211 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 SZT2Q5T011 3432 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PR77 199 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 EVPLLA8MZ36 301 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 H0YJX3 145 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 PLPP1O14494 284 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFSF14O43557 240 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1F1O43749 312 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 GMNNO75496 209 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC1-201ENST00000229304 KLK1P06870 262 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.9 ms