RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621269.4

ATXN3-253, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-253	ENST00000621269	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	TM4SF1	P30408	202 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ATXN3-253	ENST00000621269		A0A087WZG4	1122 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	PIM2	Q9P1W9	311 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	ADCY9	O60503	1353 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	KCNA3	P22001	575 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	NFIX	Q14938	502 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	MCM10	Q7L590	875 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	NEFM	P07197	916 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ATXN3-253	ENST00000621269	KCNQ3	O43525	872 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	SERPINB2	P05120	415 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	CHRNA5	P30532	468 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	DCTN1	Q14203	1278 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	A1BG	P04217	495 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ATXN3-253	ENST00000621269	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
ATXN3-253	ENST00000621269	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.82	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.81	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		31.81	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	RALBP1	Q15311	655 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269		H0YIN7	160 aa		31.79	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.79	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	NFE2L2	Q16236	605 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
ATXN3-253	ENST00000621269	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	NPHP1	O15259	732 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	TTLL6	Q8N841	843 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	PDE6B	P35913	854 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	RNF181	Q9P0P0	153 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	KIF3C	O14782	793 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ATXN3-253	ENST00000621269	NBPF26	B4DH59	902 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	ST5	P78524	1137 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	NBPF15	Q8N660	670 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	31.69	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		31.68	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		31.68	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	RASSF7	Q02833	373 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ATXN3-253	ENST00000621269	RGL2	O15211	777 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ATXN3-253	ENST00000621269	RIPK4	P57078	832 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ATXN3-253	ENST00000621269	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ATXN3-253	ENST00000621269	LMNB1	P20700	586 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ATXN3-253	ENST00000621269	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ATXN3-253	ENST00000621269	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		31.61	■■■□□ 2.65

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