RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618718.1

CITED2-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CITED2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-204ENST00000618718 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.17■■□□□ 1.14
CITED2-204ENST00000618718 STARD3NLO95772 234 aa22.17■■□□□ 1.14
CITED2-204ENST00000618718 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CITED2-204ENST00000618718 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CITED2-204ENST00000618718 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-204ENST00000618718 NFE2L2Q16236 605 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-204ENST00000618718 DCTN1Q14203 1278 aa22.14■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.14■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 SCN7AQ01118 1682 aa22.14■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 KCNQ3O43525 872 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 ZPR1O75312 459 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.134e-10■□□□□ 10.1
CITED2-204ENST00000618718 FKBP8Q14318 412 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 NARFQ9UHQ1 456 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 GRIN3BO60391 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.11■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 DDR1Q08345 913 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 A0A087WZG4 1122 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 TGFB2P61812 414 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 TM4SF1P30408 202 aa22.08■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CITED2-204ENST00000618718 BCORQ6W2J9 1755 aa22.07■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.07■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 A1BGP04217 495 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 NFIXQ14938 502 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 USP16Q9Y5T5 823 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.03■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.03■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.02■■□□□ 1.12
CITED2-204ENST00000618718 RIPK4P57078 832 aa22.01■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 A0A0G2JLW4 131 aa22■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 DPEP1P16444 411 aa22■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 RUNDC1Q96C34 613 aa22■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.99■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 CAMTA2O94983 1202 aa21.99■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.99■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.99■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 KCNA3P22001 575 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 NBPF26B4DH59 902 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 RGL2O15211 777 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 SERPINB2P05120 415 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 NBPF15Q8N660 670 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.96■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 ADCY9O60503 1353 aa21.96■■□□□ 1.11
CITED2-204ENST00000618718 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.95■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 BCS1LQ9Y276 419 aa21.95■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 PIM2Q9P1W9 311 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.93■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.93■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.92■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.92■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 ERBB4Q15303 1308 aa21.91■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 CHRNA5P30532 468 aa21.91■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 SETDB2Q96T68 719 aa21.91■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 NEUROD2Q15784 382 aa21.9■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 ATP10DQ9P241 1426 aa21.89■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
CITED2-204ENST00000618718 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.89■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 CNBD1Q8NA66 436 aa21.88■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 CHL1O00533 1208 aa21.87■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.87■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.85■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 H0YIN7 160 aa21.85■■□□□ 1.09
CITED2-204ENST00000618718 PDE6BP35913 854 aa21.85■■□□□ 1.09
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