RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599845.3

CSAG3-201, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG3, Length 844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-201ENST00000599845 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 NARFQ9UHQ1 456 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 IFFO2Q5TF58 517 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 COL15A1P39059 1388 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 DLEC1Q9Y238 1755 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 CHRNA5P30532 468 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 APLP1P51693 650 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 NMRK2Q9NPI5 230 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 NFIXQ14938 502 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CSAG3-201ENST00000599845 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 BCL2L12Q9HB09 334 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 RNF181Q9P0P0 153 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 TTC5Q8N0Z6 440 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 STARD3NLO95772 234 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 SERPINB2P05120 415 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 WDR90Q96KV7 1748 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 A0A087WZG4 1122 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 CANXP27824 592 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 EIF5P55010 431 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 GNAT3A8MTJ3 354 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 TEFQ10587 303 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 FSTL1Q12841 308 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 ZNF790Q6PG37 636 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 IL17REQ8NFR9 667 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 SCN7AQ01118 1682 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 HEG1Q9ULI3 1381 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 TTLL6Q8N841 843 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 RASSF7Q02833 373 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 C2CD5Q86YS7 1000 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 RRAGCQ9HB90 399 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG3-201ENST00000599845 H0YIN7 160 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 LMNB1P20700 586 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 TIAM2Q8IVF5 1701 aa17■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa17■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 FMNL2Q96PY5 1086 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 BCORQ6W2J9 1755 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 PRELPP51888 382 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 GLTPD2A6NH11 291 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 PDE6BP35913 854 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 CFAP53Q96M91 514 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 BTBD11A6QL63 1104 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 NFKBIEO00221 500 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 PRKAR2BP31323 418 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 KLRG1Q96E93 195 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG3-201ENST00000599845 A1BGP04217 495 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 SETDB2Q96T68 719 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 PCNTO95613 3336 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 CAMTA2O94983 1202 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 HTRA3P83110 453 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 NUDCQ9Y266 331 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 CACNA1SQ13698 1873 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 KCNQ3O43525 872 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 JMYQ8N9B5 988 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 SLX4Q8IY92 1834 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 CNBD1Q8NA66 436 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 USP16Q9Y5T5 823 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 C21orf2O43822 256 aa16.91■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 ST5P78524 1137 aa16.91■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.91■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.91■□□□□ 0.3
CSAG3-201ENST00000599845 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms