RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599766.5

FCHO1-229, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 747 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-229ENST00000599766 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 MRC1P22897 1456 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 IL13P35225 146 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 RASSF7Q02833 373 aa23.09■■□□□ 1.29
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FCHO1-229ENST00000599766 COL15A1P39059 1388 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-229ENST00000599766 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.08■■□□□ 1.28
FCHO1-229ENST00000599766 GLTPD2A6NH11 291 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-229ENST00000599766 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-229ENST00000599766 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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FCHO1-229ENST00000599766 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-229ENST00000599766 PRELPP51888 382 aa23.05■■□□□ 1.28
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FCHO1-229ENST00000599766 SLC39A6Q13433 755 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-229ENST00000599766 TTLL6Q8N841 843 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-229ENST00000599766 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.04■■□□□ 1.28
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FCHO1-229ENST00000599766 H0YIN7 160 aa23■■□□□ 1.27
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FCHO1-229ENST00000599766 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-229ENST00000599766 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.98■■□□□ 1.27
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FCHO1-229ENST00000599766 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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FCHO1-229ENST00000599766 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-229ENST00000599766 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-229ENST00000599766 SCN7AQ01118 1682 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-229ENST00000599766 A0A087WZG4 1122 aa22.94■■□□□ 1.26
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FCHO1-229ENST00000599766 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-229ENST00000599766 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.86■■□□□ 1.25
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FCHO1-229ENST00000599766 CHADLQ6NUI6 762 aa22.86■■□□□ 1.25
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FCHO1-229ENST00000599766 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.85■■□□□ 1.25
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FCHO1-229ENST00000599766 IL17REQ8NFR9 667 aa22.83■■□□□ 1.25
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FCHO1-229ENST00000599766 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.82■■□□□ 1.24
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FCHO1-229ENST00000599766 SETDB2Q96T68 719 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 CAMTA2O94983 1202 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 POTEIP0CG38 1075 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 POTEJP0CG39 1038 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 SRGNP10124 158 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 SOGA3Q5TF21 947 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 SCN4AP35499 1836 aa22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-229ENST00000599766 ST5P78524 1137 aa22.8■■□□□ 1.24
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