RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 ATP8B2P98198 1209 aa27.89■■■□□ 2.06
USP36-218ENST00000590546 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.89■■■□□ 2.06
USP36-218ENST00000590546 PHLPP1O60346 1717 aa27.88■■■□□ 2.05
USP36-218ENST00000590546 ANXA1P04083 346 aa27.88■■■□□ 2.05
USP36-218ENST00000590546 PDIA6Q15084 440 aa27.88■■■□□ 2.05
USP36-218ENST00000590546 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
USP36-218ENST00000590546 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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USP36-218ENST00000590546 DISP2A7MBM2 1401 aa27.84■■■□□ 2.05
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USP36-218ENST00000590546 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
USP36-218ENST00000590546 LINS1Q8NG48 757 aa27.82■■■□□ 2.04
USP36-218ENST00000590546 USP35Q9P2H5 1018 aa27.82■■■□□ 2.04
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USP36-218ENST00000590546 USP16Q9Y5T5 823 aa27.81■■■□□ 2.04
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USP36-218ENST00000590546 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.79■■■□□ 2.04
USP36-218ENST00000590546 SSH3Q8TE77 659 aa27.79■■■□□ 2.04
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USP36-218ENST00000590546 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.78■■■□□ 2.04
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USP36-218ENST00000590546 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
USP36-218ENST00000590546 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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USP36-218ENST00000590546 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.77■■■□□ 2.04
USP36-218ENST00000590546 MYL6BP14649 208 aa27.77■■■□□ 2.04
USP36-218ENST00000590546 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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USP36-218ENST00000590546 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
USP36-218ENST00000590546 COPS6Q7L5N1 327 aa27.76■■■□□ 2.03
USP36-218ENST00000590546 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.76■■■□□ 2.03
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USP36-218ENST00000590546 EXOC5O00471 708 aa27.76■■■□□ 2.03
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USP36-218ENST00000590546 RAB11FIP3O75154 756 aa27.75■■■□□ 2.03
USP36-218ENST00000590546 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.75■■■□□ 2.03
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USP36-218ENST00000590546 MTX1Q13505 466 aa27.74■■■□□ 2.03
USP36-218ENST00000590546 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.74■■■□□ 2.03
USP36-218ENST00000590546 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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USP36-218ENST00000590546 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.73■■■□□ 2.03
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USP36-218ENST00000590546 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.71■■■□□ 2.03
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USP36-218ENST00000590546 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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USP36-218ENST00000590546 IGKV5-2P06315 115 aa27.67■■■□□ 2.02
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USP36-218ENST00000590546 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
USP36-218ENST00000590546 MYD88Q99836 296 aa27.65■■■□□ 2.02
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USP36-218ENST00000590546 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.65■■■□□ 2.02
USP36-218ENST00000590546 PDE1AP54750 535 aa27.64■■■□□ 2.02
USP36-218ENST00000590546 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.64■■■□□ 2.02
USP36-218ENST00000590546 SLIT2O94813 1529 aa27.64■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NBPF26B4DH59 902 aa27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NBPF14Q5TI25 921 aa27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 NBPF15Q8N660 670 aa27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
USP36-218ENST00000590546 BCL9O00512 1426 aa27.63■■■□□ 2.01
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