RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.19■□□□□ 0.18
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CAPNS1-209ENST00000590049 STAC3Q96MF2 364 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-209ENST00000590049 ITGB4P16144 1822 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-209ENST00000590049 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-209ENST00000590049 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-209ENST00000590049 FKBP8Q14318 412 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-209ENST00000590049 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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CAPNS1-209ENST00000590049 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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CAPNS1-209ENST00000590049 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.13■□□□□ 0.17
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CAPNS1-209ENST00000590049 NME9Q86XW9 330 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-209ENST00000590049 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-209ENST00000590049 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.11■□□□□ 0.17
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CAPNS1-209ENST00000590049 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.08■□□□□ 0.17
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.08■□□□□ 0.16
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CAPNS1-209ENST00000590049 ATG3Q9NT62 314 aa16.06■□□□□ 0.16
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-209ENST00000590049 TRPA1O75762 1119 aa16.03■□□□□ 0.16
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CAPNS1-209ENST00000590049 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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CAPNS1-209ENST00000590049 SOGA3Q5TF21 947 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF186Q9NXI6 227 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-209ENST00000590049 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.02■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.02■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 ZPR1O75312 459 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 SERPINB2P05120 415 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 GPC2Q8N158 579 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.99■□□□□ 0.15
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CAPNS1-209ENST00000590049 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP290O15078 2479 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 OTUD5Q96G74 571 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-209ENST00000590049 FZD9O00144 591 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 PDE6BP35913 854 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 SYNE4Q8N205 404 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 CNKSR1Q969H4 720 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-209ENST00000590049 RTL1A6NKG5 1358 aa15.93■□□□□ 0.14
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