RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 NECTIN2Q92692 538 aa19.2■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 USP21Q9UK80 565 aa19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 NHSQ6T4R5 1651 aa19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 ADCY9O60503 1353 aa19.19■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.18■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 PDIA6Q15084 440 aa19.18■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 HYPKQ9NX55 129 aa19.18■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.18■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 RREB1Q92766 1687 aa19.17■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 AFF2P51816 1311 aa19.17■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 PROSER3Q2NL68 480 aa19.16■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.16■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.16■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 PIGBQ92521 554 aa19.16■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 F6X3S4 739 aa19.15■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 IGHDP01880 384 aa19.15■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
EFTUD2-214ENST00000589769 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 ATG3Q9NT62 314 aa19.13■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.12■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 USP16Q9Y5T5 823 aa19.12■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 ANXA1P04083 346 aa19.11■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 KSR2Q6VAB6 950 aa19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 MEIS3Q99687 375 aa19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 BEND3Q5T5X7 828 aa19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 SBF2Q86WG5 1849 aa19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-214ENST00000589769 SMC5Q8IY18 1101 aa19.08■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.08■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 BTAF1O14981 1849 aa19.08■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 ALDH1L1O75891 902 aa19.07■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 GNAI3P08754 354 aa19.07■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 NBPF26B4DH59 902 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 NBPF14Q5TI25 921 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 NBPF15Q8N660 670 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKRD44Q8N8A2 993 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP85Q6P2H3 762 aa19.05■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 SIRT2Q8IXJ6 389 aa19.05■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 LY75O60449 1722 aa19.04■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 LINS1Q8NG48 757 aa19.04■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.04■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 PALLDQ8WX93 1383 aa19.04■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.04■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 GNAI2P04899 355 aa19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 MYL6BP14649 208 aa19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 COPS6Q7L5N1 327 aa19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 GCC1Q96CN9 775 aa19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 USP44Q9H0E7 712 aa19.03■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 UTYO14607 1347 aa19.02■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 BRWD3Q6RI45 1802 aa19.02■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.02■□□□□ 0.64
EFTUD2-214ENST00000589769 STARD3NLO95772 234 aa19.01■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 ACSBG1Q96GR2 724 aa19■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 COL15A1P39059 1388 aa19■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 BCORQ6W2J9 1755 aa18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 A1BGP04217 495 aa18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 A0A0G2JS52 829 aa18.98■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 HMMRO75330 724 aa18.98■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 IGKV5-2P06315 115 aa18.98■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 MYT1Q01538 1121 aa18.98■□□□□ 0.63
EFTUD2-214ENST00000589769 NUCB1Q02818 461 aa18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms