RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.53■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 NARFQ9UHQ1 456 aa24.53■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 KCNA3P22001 575 aa24.52■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 PRKAR2BP31323 418 aa24.52■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.52■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 NUDCQ9Y266 331 aa24.52■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 BCS1LQ9Y276 419 aa24.52■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.51■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 ZNF790Q6PG37 636 aa24.51■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.5■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.49■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 STARD3NLO95772 234 aa24.48■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.48■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.47■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 FCHSD2O94868 740 aa24.47■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 NFIXQ14938 502 aa24.46■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 PIM2Q9P1W9 311 aa24.46■■□□□ 1.51
CTIF-206ENST00000588345 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.44■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 A0A087WZG4 1122 aa24.43■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 BTBD11A6QL63 1104 aa24.42■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.42■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 SCN7AQ01118 1682 aa24.42■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 CHRNA5P30532 468 aa24.41■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.4■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 KCNQ3O43525 872 aa24.4■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 SERPINB2P05120 415 aa24.4■■□□□ 1.5
CTIF-206ENST00000588345 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 MCM10Q7L590 875 aa24.37■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 KIF3CO14782 793 aa24.36■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 A1BGP04217 495 aa24.35■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 BCORQ6W2J9 1755 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 USP16Q9Y5T5 823 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 SBF1O95248 1867 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 DCTN1Q14203 1278 aa24.33■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.33■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.33■■□□□ 1.49
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.32■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.32■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 CAMTA2O94983 1202 aa24.31■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.3■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.3■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.29■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 H0YIN7 160 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 NEFMP07197 916 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 TTLL6Q8N841 843 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 HSPA6P17066 643 aa24.27■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.27■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 RNF181Q9P0P0 153 aa24.27■■□□□ 1.48
CTIF-206ENST00000588345 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.26■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.26■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 PDE6BP35913 854 aa24.25■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.25■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 SETDB2Q96T68 719 aa24.25■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.25■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 NBPF26B4DH59 902 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 RGL2O15211 777 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 NFE2L2Q16236 605 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 NBPF15Q8N660 670 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 TOMM70O94826 608 aa24.23■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 RASSF7Q02833 373 aa24.23■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 RALBP1Q15311 655 aa24.22■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 CNBD1Q8NA66 436 aa24.22■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.22■■□□□ 1.47
CTIF-206ENST00000588345 CEP350Q5VT06 3117 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 LMNB1P20700 586 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 PRELPP51888 382 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 ST5P78524 1137 aa24.19■■□□□ 1.46
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