RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa36.48■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GNAI2P04899 355 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLIT2O94813 1529 aa36.47■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-208ENST00000573600 USP16Q9Y5T5 823 aa36.42■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 USP44Q9H0E7 712 aa36.39■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRP10Q7Z4F1 713 aa36.31■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGBQ92521 554 aa36.3■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.11■■■■□ 3.37
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