RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 APLP1P51693 650 aa18.63■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.63■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.63■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.62■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.62■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 COL15A1P39059 1388 aa18.61■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.61■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 PRELPP51888 382 aa18.61■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 HTRA3P83110 453 aa18.61■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.6■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 NFIXQ14938 502 aa18.6■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 RNF181Q9P0P0 153 aa18.6■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 RASSF7Q02833 373 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SPNS3-202ENST00000572078 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 NARFQ9UHQ1 456 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 ZPR1O75312 459 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 SCN7AQ01118 1682 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 RRAGCQ9HB90 399 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 SERPINB2P05120 415 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-202ENST00000572078 NFKBIEO00221 500 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 FSTL1Q12841 308 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 IL17REQ8NFR9 667 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 KLRG1Q96E93 195 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 LMNB1P20700 586 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 TTLL6Q8N841 843 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 JMYQ8N9B5 988 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 BCORQ6W2J9 1755 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 POTECB2RU33 542 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF790Q6PG37 636 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 PCNTO95613 3336 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-202ENST00000572078 GLTPD2A6NH11 291 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 KCNQ3O43525 872 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 CACNA1SQ13698 1873 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 H0YIN7 160 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 STARD3NLO95772 234 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 A1BGP04217 495 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 SLX4Q8IY92 1834 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 CAMTA2O94983 1202 aa18.42■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 TEFQ10587 303 aa18.42■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 A0A087WZG4 1122 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 C21orf2O43822 256 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS3-202ENST00000572078 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 PRKAR2BP31323 418 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 USP16Q9Y5T5 823 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 POTEIP0CG38 1075 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 POTEJP0CG39 1038 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 PDE6BP35913 854 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 BTBD11A6QL63 1104 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 CNBD1Q8NA66 436 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms