RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.94■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 NARFQ9UHQ1 456 aa29.93■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 PXDNLA1KZ92 1463 aa29.93■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 COL15A1P39059 1388 aa29.92■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.92■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.92■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 NEFMP07197 916 aa29.91■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 TM4SF1P30408 202 aa29.91■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 DDR1Q08345 913 aa29.91■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 DPEP1P16444 411 aa29.9■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 MCM10Q7L590 875 aa29.89■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 BCS1LQ9Y276 419 aa29.89■■■□□ 2.38
CLN3-232ENST00000568443 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
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CLN3-232ENST00000568443 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 A0A087WZG4 1122 aa29.87■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 KCNQ3O43525 872 aa29.87■■■□□ 2.37
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CLN3-232ENST00000568443 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa29.85■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 DCTN1Q14203 1278 aa29.85■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 NFIXQ14938 502 aa29.84■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.84■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
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CLN3-232ENST00000568443 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CLN3-232ENST00000568443 KCNA3P22001 575 aa29.82■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 RALBP1Q15311 655 aa29.82■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 PIM2Q9P1W9 311 aa29.82■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 A1BGP04217 495 aa29.81■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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CLN3-232ENST00000568443 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
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CLN3-232ENST00000568443 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.79■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.79■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 USP16Q9Y5T5 823 aa29.79■■■□□ 2.36
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CLN3-232ENST00000568443 C1QTNF8P60827 252 aa29.78■■■□□ 2.36
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CLN3-232ENST00000568443 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.78■■■□□ 2.36
CLN3-232ENST00000568443 CHRNA5P30532 468 aa29.77■■■□□ 2.36
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CLN3-232ENST00000568443 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.63■■■□□ 2.33
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CLN3-232ENST00000568443 NPHP1O15259 732 aa29.63■■■□□ 2.33
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CLN3-232ENST00000568443 NBPF15Q8N660 670 aa29.63■■■□□ 2.33
CLN3-232ENST00000568443 RIPK4P57078 832 aa29.62■■■□□ 2.33
CLN3-232ENST00000568443 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.62■■■□□ 2.33
CLN3-232ENST00000568443 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.62■■■□□ 2.33
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CLN3-232ENST00000568443 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.62■■■□□ 2.33
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CLN3-232ENST00000568443 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.61■■■□□ 2.33
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CLN3-232ENST00000568443 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.57■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 ST5P78524 1137 aa29.56■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.56■■■□□ 2.32
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CLN3-232ENST00000568443 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 RNF181Q9P0P0 153 aa29.56■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 BCORQ6W2J9 1755 aa29.56■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 RGL2O15211 777 aa29.55■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.55■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.54■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.54■■■□□ 2.32
CLN3-232ENST00000568443 NGEFQ8N5V2 710 aa29.54■■■□□ 2.32
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