RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL17REQ8NFR9 667 aa9.62□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.62□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRNA5P30532 468 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 TGFB2P61812 414 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUDCQ9Y266 331 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCN7AQ01118 1682 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNQ3O43525 872 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFIXQ14938 502 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF790Q6PG37 636 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCM10Q7L590 875 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 NARFQ9UHQ1 456 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 UTRNP46939 3433 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 STARD3NLO95772 234 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNA3P22001 575 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCTN1Q14203 1278 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTBD11A6QL63 1104 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 A1BGP04217 495 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINB2P05120 415 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 TM4SF1P30408 202 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIM2Q9P1W9 311 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.56□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.56□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASSF7Q02833 373 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCORQ6W2J9 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A087WZG4 1122 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPHP1O15259 732 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF181Q9P0P0 153 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP16Q9Y5T5 823 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF3CO14782 793 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAMTA2O94983 1202 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEFMP07197 916 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.52□□□□□ -0.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNA1SQ13698 1873 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM177BA6PVY3 158 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 H0YIN7 160 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTLL6Q8N841 843 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNBD1Q8NA66 436 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF26B4DH59 902 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA6P17066 643 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFE2L2Q16236 605 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NGEFQ8N5V2 710 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF15Q8N660 670 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 SETDB2Q96T68 719 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 SBF1O95248 1867 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 C21orf2O43822 256 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRELPP51888 382 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 ST5P78524 1137 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFKBIEO00221 500 aa9.48□□□□□ -0.89
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