RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 SBF1O95248 1867 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.45■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 PCNTO95613 3336 aa23.44■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 FSTL1Q12841 308 aa23.44■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 NUDCQ9Y266 331 aa23.44■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 TJP1Q07157 1748 aa23.44■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 JMYQ8N9B5 988 aa23.42■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 RASSF7Q02833 373 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 PRKAR2BP31323 418 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 SLC39A6Q13433 755 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.39■■□□□ 1.34
RNPS1-222ENST00000567147 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.39■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 IL17REQ8NFR9 667 aa23.38■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 TM4SF1P30408 202 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 TNS4Q8IZW8 715 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 ZPR1O75312 459 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 PRELPP51888 382 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 TEFQ10587 303 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-222ENST00000567147 MRC1P22897 1456 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 NFIXQ14938 502 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 GLTPD2A6NH11 291 aa23.28■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 LMNB1P20700 586 aa23.28■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF790Q6PG37 636 aa23.27■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.27■■□□□ 1.32
RNPS1-222ENST00000567147 SERPINB2P05120 415 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 RALBP1Q15311 655 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 NARFQ9UHQ1 456 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 COL15A1P39059 1388 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 MCM10Q7L590 875 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 TTLL6Q8N841 843 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 BTBD11A6QL63 1104 aa23.24■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.24■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 NFKBIEO00221 500 aa23.23■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 STARD3NLO95772 234 aa23.23■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 KCNQ3O43525 872 aa23.22■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 NEFMP07197 916 aa23.22■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 DCTN1Q14203 1278 aa23.22■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.22■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 POTECB2RU33 542 aa23.21■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RNPS1-222ENST00000567147 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.2■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 H0YIN7 160 aa23.2■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.2■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.2■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.19■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 C21orf2O43822 256 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 CACNA1SQ13698 1873 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-222ENST00000567147 A1BGP04217 495 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-222ENST00000567147 NFE2L2Q16236 605 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-222ENST00000567147 ERFEQ4G0M1 354 aa23.14■■□□□ 1.29
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