RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	SOCS7	O14512	581 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	RGS3	P49796	1198 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	LY75	O60449	1722 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	TEF	Q10587	303 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	KCNQ3	O43525	872 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	KRT24	Q2M2I5	525 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	ABCC4	O15439	1325 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	PROM2	Q8N271	834 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	BAG6	P46379	1132 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TCF4-231	ENST00000566279	RREB1	Q92766	1687 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	FAM161A	Q3B820	660 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	BTBD11	A6QL63	1104 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC125	Q86Z20	511 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	PLSCR1	O15162	318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	TJP1	Q07157	1748 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	C5	P01031	1676 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF790	Q6PG37	636 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	SIK1	P57059	783 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	ITPK1	Q13572	414 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	SMC5	Q8IY18	1101 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TCF4-231	ENST00000566279	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	PTPRC	P08575	1304 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	CACNA1F	O60840	1977 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	G2E3	Q7L622	706 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	USP16	Q9Y5T5	823 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	NUCB1	Q02818	461 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	PHF14	O94880	888 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TCF4-231	ENST00000566279	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37

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