RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	COL15A1	P39059	1388 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD3NL	O95772	234 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TM4SF1	P30408	202 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DDR1	Q08345	913 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZPR1	O75312	459 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFB2	P61812	414 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NEFM	P07197	916 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	A1BG	P04217	495 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JLW4	131 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	NFIX	Q14938	502 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WZG4	1122 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		28.83	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	DPEP1	P16444	411 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNA3	P22001	575 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB2	P05120	415 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	RIPK4	P57078	832 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCY9	O60503	1353 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA5	P30532	468 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.68	■■■□□ 2.18	1e-7	■■□□□ 13.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	RGL2	O15211	777 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-205	ENST00000563200	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YIN7	160 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CHL1	O00533	1208 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	HLF	Q16534	295 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16

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