RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 GDF11O95390 407 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-204ENST00000561685 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-204ENST00000561685 UCN2Q96RP3 112 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-204ENST00000561685 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRN3-204ENST00000561685 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RRN3-204ENST00000561685 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-204ENST00000561685 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 BNIP3LO60238 219 aa7.39□□□□□ -1.23
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RRN3-204ENST00000561685 PODNQ7Z5L7 613 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 BMP4P12644 408 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 IRS1P35568 1242 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 EPHA4P54764 986 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 KLRG1Q96E93 195 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 USP3Q9Y6I4 520 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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RRN3-204ENST00000561685 A6NJR5 290 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 M0R2N6 131 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 FOXK2Q01167 660 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 TEAD4Q15561 434 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 GLMNQ92990 594 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 FAM182BQ5T319 152 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 CCDC102BQ68D86 513 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 FAM157BP0CG42 384 aa7.35□□□□□ -1.23
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RRN3-204ENST00000561685 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 SIX5Q8N196 739 aa7.35□□□□□ -1.23
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RRN3-204ENST00000561685 ZIC5Q96T25 663 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3-204ENST00000561685 ARAFP10398 606 aa7.34□□□□□ -1.23
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RRN3-204ENST00000561685 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.33□□□□□ -1.24
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RRN3-204ENST00000561685 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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RRN3-204ENST00000561685 EFSO43281 561 aa7.3□□□□□ -1.24
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RRN3-204ENST00000561685 ADH6P28332 368 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 MARK1Q9P0L2 795 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 EPXP11678 715 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 CD33P20138 364 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 SEC13P55735 322 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 TBCELQ5QJ74 424 aa7.29□□□□□ -1.24
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