RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANXA1P04083 346 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS3P49796 1198 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIGBQ92521 554 aa22.45■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGB4P16144 1822 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL9O00512 1426 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDIA6Q15084 440 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 HYPKQ9NX55 129 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP16Q9Y5T5 823 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 PROSER3Q2NL68 480 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEIS3Q99687 375 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 AFF2P51816 1311 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATG3Q9NT62 314 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERBB4Q15303 1308 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATRNO75882 1429 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMC5Q8IY18 1101 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADCY9O60503 1353 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE4AP27815 886 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 KSR2Q6VAB6 950 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP10DQ9P241 1426 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYL6BP14649 208 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-208ENST00000560962 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 BEND3Q5T5X7 828 aa22.33■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP85Q6P2H3 762 aa22.33■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.33■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF26B4DH59 902 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAI3P08754 354 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF14Q5TI25 921 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 COPS6Q7L5N1 327 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF15Q8N660 670 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0G2JS52 829 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAI2P04899 355 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYT1Q01538 1121 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCC1Q96CN9 775 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 BACH2Q9BYV9 841 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP44Q9H0E7 712 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUCB1Q02818 461 aa22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 A1BGP04217 495 aa22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALDH1L1O75891 902 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 LNPKQ9C0E8 428 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 STARD3NLO95772 234 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.27■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINS1Q8NG48 757 aa22.27■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCTPP1Q9H773 170 aa22.27■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNQ2O43526 872 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM161AQ3B820 660 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 TJP1Q07157 1748 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMMRO75330 724 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-208ENST00000560962 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms