RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 KANK1Q14678 1352 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 ERFEQ4G0M1 354 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 CDK15Q96Q40 435 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 AXIN1O15169 862 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 GPR37L1O60883 481 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 NNTQ13423 1086 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 SNRKQ9NRH2 765 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-204ENST00000558666 APBB1O00213 710 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 FSHRP23945 695 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 PTK2Q05397 1052 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NAIPQ13075 1403 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ARID5BQ14865 1188 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP1Q9C000 1473 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NR3C2P08235 984 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NR5A1Q13285 461 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB33Q86T24 672 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ADAM32Q8TC27 787 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 DACH1Q9UI36 760 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 PLA2R1Q13018 1463 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 TRPM2O94759 1503 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ROCK1Q13464 1354 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 GRM5P41594 1212 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NUP155O75694 1391 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 HFM1A2PYH4 1435 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 FBXO45P0C2W1 286 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 TIMP2P16035 220 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 MCM6Q14566 821 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 SLIT1O75093 1534 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ZBBXA8MT70 800 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM52Q96A61 297 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NOS1P29475 1434 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 POTECB2RU33 542 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 BMP1P13497 986 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 NWD1Q149M9 1564 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF787Q6DD87 383 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 ITPKCQ96DU7 683 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-204ENST00000558666 PTPRTO14522 1441 aa6.4□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.4□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 NR1H3Q13133 447 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PHLPP1O60346 1717 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 MEIOBQ8N635 442 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM47Q96LD4 638 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ALKQ9UM73 1620 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 DIP2AQ14689 1571 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 CPS1P31327 1500 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 MED14O60244 1454 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ZFYVE9O95405 1425 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ESPNB1AK53 854 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 IRF5Q13568 498 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 IDI1Q13907 227 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SENP2Q9HC62 589 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.37□□□□□ -1.39
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