RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.5■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 MS4A1P11836 297 aa30.48■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 VSIG10Q8N0Z9 540 aa30.48■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 BAG6P46379 1132 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 PDE3AQ14432 1141 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.46■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.45■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 BTAF1O14981 1849 aa30.45■■■□□ 2.47
MEIS3-204ENST00000558555 USP16Q9Y5T5 823 aa30.44■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRCP08575 1304 aa30.43■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 PALLDQ8WX93 1383 aa30.43■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.43■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM27P14373 513 aa30.42■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 APBA3O96018 575 aa30.41■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.4■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 HYPKQ9NX55 129 aa30.4■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 ERBB4Q15303 1308 aa30.4■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.39■■■□□ 2.46
MEIS3-204ENST00000558555 STARD3NLO95772 234 aa30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 FLIIQ13045 1269 aa30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 G2E3Q7L622 706 aa30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 PTF1AQ7RTS3 328 aa30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 PANK1Q8TE04 598 aa30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJC10Q8IXB1 793 aa30.38■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.37■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 SIK1P57059 783 aa30.37■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 TNNQ9UQP3 1299 aa30.37■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 TJP1Q07157 1748 aa30.36■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 ANXA1P04083 346 aa30.36■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 SLC4A9Q96Q91 983 aa30.36■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 CRBNQ96SW2 442 aa30.36■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 ATP6V1AP38606 617 aa30.35■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 PDIA6Q15084 440 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 PROSER3Q2NL68 480 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF831Q5JPB2 1677 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 RLBP1P12271 317 aa30.33■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 MYL6BP14649 208 aa30.33■■■□□ 2.45
MEIS3-204ENST00000558555 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.32■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 COG6Q9Y2V7 657 aa30.32■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC4O15439 1325 aa30.31■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 A1BGP04217 495 aa30.31■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 LY75O60449 1722 aa30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF26B4DH59 902 aa30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF14Q5TI25 921 aa30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF15Q8N660 670 aa30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-204ENST00000558555 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.26■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 ITPK1Q13572 414 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 RREB1Q92766 1687 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 F6X3S4 739 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 COPS6Q7L5N1 327 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC87Q9NVE4 849 aa30.23■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 KSR2Q6VAB6 950 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 PXDNLA1KZ92 1463 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 CRKLP46109 303 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.2■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa30.2■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
MEIS3-204ENST00000558555 ADCY9O60503 1353 aa30.2■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 AAMPQ13685 434 aa30.19■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.19■■■□□ 2.42
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