RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558291.1

GDPGP1-203, Transcript of GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDPGP1, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1-203ENST00000558291 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GDPGP1-203ENST00000558291 FKBP8Q14318 412 aa23.33■■□□□ 1.33
GDPGP1-203ENST00000558291 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GDPGP1-203ENST00000558291 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.32■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 TM4SF1P30408 202 aa23.32■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.32■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.31■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 DDR1Q08345 913 aa23.3■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.3■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.3■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.29■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 A0A0G2JLW4 131 aa23.28■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 DPEP1P16444 411 aa23.28■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 PIM2Q9P1W9 311 aa23.28■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 BCS1LQ9Y276 419 aa23.28■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 BTBD11A6QL63 1104 aa23.27■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 NEFMP07197 916 aa23.27■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GDPGP1-203ENST00000558291 SCN7AQ01118 1682 aa23.25■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 KCNA3P22001 575 aa23.24■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 NFIXQ14938 502 aa23.24■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.23■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 RGL2O15211 777 aa23.21■■□□□ 1.31
GDPGP1-203ENST00000558291 SERPINB2P05120 415 aa23.2■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.19■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.18■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.18■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 RALBP1Q15311 655 aa23.18■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 BCORQ6W2J9 1755 aa23.17■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 MCM10Q7L590 875 aa23.16■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPGP1-203ENST00000558291 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 CHRNA5P30532 468 aa23.13■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.13■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.13■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 H0YIN7 160 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 KCNQ3O43525 872 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 CAMTA2O94983 1202 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 A1BGP04217 495 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 PDE6BP35913 854 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 TTLL6Q8N841 843 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 NFE2L2Q16236 605 aa23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 SETDB2Q96T68 719 aa23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 USP16Q9Y5T5 823 aa23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 SBF1O95248 1867 aa23.09■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.09■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.09■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 KIF3CO14782 793 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 DCTN1Q14203 1278 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 CNBD1Q8NA66 436 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1-203ENST00000558291 ST5P78524 1137 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.06■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 HSPA6P17066 643 aa23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 RNF181Q9P0P0 153 aa23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 NPHP1O15259 732 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 TOMM70O94826 608 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 LMNB1P20700 586 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 ERBB4Q15303 1308 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 CEP350Q5VT06 3117 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 SOGA3Q5TF21 947 aa23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.02■■□□□ 1.28
GDPGP1-203ENST00000558291 STYK1Q6J9G0 422 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms