RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 PANK1Q8TE04 598 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 PALLDQ8WX93 1383 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 LY75O60449 1722 aa22.19■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.19■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.19■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.19■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.19■■□□□ 1.14
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LGMN-216ENST00000557434 STK31Q9BXU1 1019 aa22.18■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 PDE3AQ14432 1141 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 NBPF26B4DH59 902 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 NEFLP07196 543 aa22.17■■□□□ 1.14
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LGMN-216ENST00000557434 NBPF15Q8N660 670 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 CRBNQ96SW2 442 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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LGMN-216ENST00000557434 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.16■■□□□ 1.14
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LGMN-216ENST00000557434 FLIIQ13045 1269 aa22.16■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 ITPK1Q13572 414 aa22.15■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.15■■□□□ 1.14
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LGMN-216ENST00000557434 A1BGP04217 495 aa22.15■■□□□ 1.14
LGMN-216ENST00000557434 PTPRCP08575 1304 aa22.14■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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LGMN-216ENST00000557434 TRIM37O94972 964 aa22.13■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 KCNQ4P56696 695 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 COG6Q9Y2V7 657 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 F6X3S4 739 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 MYL6BP14649 208 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-216ENST00000557434 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.12■■□□□ 1.13
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LGMN-216ENST00000557434 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.07■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 STARD3NLO95772 234 aa22.07■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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LGMN-216ENST00000557434 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.07■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.06■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.05■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.05■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.05■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 MS4A1P11836 297 aa22.04■■□□□ 1.12
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LGMN-216ENST00000557434 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.04■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.03■■□□□ 1.12
LGMN-216ENST00000557434 PROM2Q8N271 834 aa22.03■■□□□ 1.12
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LGMN-216ENST00000557434 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.99■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.99■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.99■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 ATP10DQ9P241 1426 aa21.99■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.99■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.98■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 PLSCR1O15162 318 aa21.97■■□□□ 1.11
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