RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555123.5

PAPLN-207, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 4,108 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-207ENST00000555123 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.67□□□□□ -0.06
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PAPLN-207ENST00000555123 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PAPLN-207ENST00000555123 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PAPLN-207ENST00000555123 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.67□□□□□ -0.06
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PAPLN-207ENST00000555123 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PAPLN-207ENST00000555123 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.66□□□□□ -0.06
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PAPLN-207ENST00000555123 MCM6Q14566 821 aa14.65□□□□□ -0.06
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PAPLN-207ENST00000555123 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 STX1AQ16623 288 aa14.64□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.64□□□□□ -0.07
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PAPLN-207ENST00000555123 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.64□□□□□ -0.07
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PAPLN-207ENST00000555123 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.62□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 CTAGE5O15320 804 aa14.62□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.62□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 SMARCE1Q969G3 411 aa14.62□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.62□□□□□ -0.07
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PAPLN-207ENST00000555123 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.61□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 SYNJ2O15056 1496 aa14.61□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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PAPLN-207ENST00000555123 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 CHMLP26374 656 aa14.6□□□□□ -0.07
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PAPLN-207ENST00000555123 USP16Q9Y5T5 823 aa14.6□□□□□ -0.07
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PAPLN-207ENST00000555123 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 PHACTR2O75167 634 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 CAVIN2O95810 425 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 ANXA1P04083 346 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 ATP2B3Q16720 1220 aa14.6□□□□□ -0.07
PAPLN-207ENST00000555123 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.6□□□□□ -0.07
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