RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 KCNQ3O43525 872 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PLEKHG5O94827 1062 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ABTB2Q8N961 1025 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 IP6K1Q92551 441 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 LTN1O94822 1766 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 BEND3Q5T5X7 828 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 FBXO3Q9UK99 471 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 HSPA4P34932 840 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 RILPL2Q969X0 211 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 RAB11FIP3O75154 756 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 MCM2P49736 904 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ADCY9O60503 1353 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 NCAPD2Q15021 1401 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 HOXB7P09629 217 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SGSM2O43147 1006 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 TTC14Q96N46 770 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 MTX1Q13505 466 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 RASEFQ8IZ41 740 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SRGAP3O43295 1099 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ANXA1P04083 346 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 RAD50Q92878 1312 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 MCCP23508 829 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PROSER3Q2NL68 480 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 KCNB2Q92953 911 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PXDNQ92626 1479 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 RUFY3Q7L099 469 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 KAZALD1Q96I82 304 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SYCE3A1L190 88 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 HS1BP3Q53T59 392 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 TCHHQ07283 1943 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 SLIT3O75094 1523 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-211ENST00000552253 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms