RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		19.02	■□□□□ 0.64
CS-231	ENST00000552222	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	NFIX	Q14938	502 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		19.01	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		19	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	LBX1	P52954	281 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	TJP1	Q07157	1748 aa		18.99	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	CREBZF	Q9NS37	354 aa		18.98	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	VEGFB	P49765	207 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	TTLL6	Q8N841	843 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-231	ENST00000552222	CNTNAP1	P78357	1384 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	C21orf2	O43822	256 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	SERPINB2	P05120	415 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	ZPR1	O75312	459 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	MTHFS	P49914	203 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	ERFE	Q4G0M1	354 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	ABHD8	Q96I13	439 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	SLC39A6	Q13433	755 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	CDCA8	Q53HL2	280 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	PASK	Q96RG2	1323 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-231	ENST00000552222	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222		H0YIN7	160 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	LGR6	Q9HBX8	967 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	WBP1L	Q9NX94	342 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	NARF	Q9UHQ1	456 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	COL15A1	P39059	1388 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		18.86	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	18.86	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		18.86	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		18.85	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		18.85	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		18.84	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		18.84	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	TSKS	Q9UJT2	592 aa		18.84	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		18.83	■□□□□ 0.61
CS-231	ENST00000552222	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.83	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		18.82	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		18.82	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.82	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		18.82	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		18.81	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		18.81	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.81	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.81	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	SLX4	Q8IY92	1834 aa		18.8	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	GRM1	Q13255	1194 aa		18.8	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		18.8	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		18.79	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		18.78	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	CACNA1S	Q13698	1873 aa		18.77	■□□□□ 0.6
CS-231	ENST00000552222	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		18.76	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	CFAP44	Q96MT7	982 aa		18.76	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		18.76	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	RASSF10	A6NK89	507 aa		18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	CNTROB	Q8N137	903 aa		18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		18.74	■□□□□ 0.59

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