RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	BNIP3L	O60238	219 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	BMP4	P12644	408 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	FGFR3	P22607	806 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	VAC14	Q08AM6	782 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM23	O75077	832 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	SCNN1D	P51172	638 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	CTBS	Q01459	385 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	INHA	P05111	366 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF10	P55107	478 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP4A	P20648	1035 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	COL8A1	P27658	744 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SMTN	P53814	917 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	WASHC4	Q2M389	1173 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	ARAF	P10398	606 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	EPX	P11678	715 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	AMPD1	P23109	780 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SOX11	P35716	441 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PNR3	127 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3R2	O00459	728 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	CDK2AP1	O14519	115 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	GNB5	O14775	395 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	BAG6	P46379	1132 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	MTFR1	Q15390	333 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	ALG2	Q9H553	416 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NJY4	79 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	RFX1	P22670	979 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	DGKG	P49619	791 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	TNP2	Q05952	138 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	CD33	P20138	364 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	ADH6	P28332	368 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SNHG1-222	ENST00000545308	BACH1	O14867	736 aa		7.17	□□□□□ -1.26

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