RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 HYPKQ9NX55 129 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 MYL6BP14649 208 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 FAM182BQ5T319 152 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 PIGBQ92521 554 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 USP54Q70EL1 1684 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 VAMP4O75379 141 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 SHPRHQ149N8 1683 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 LRP6O75581 1613 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 BCAR3O75815 825 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 APBA3O96018 575 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 TNS2Q63HR2 1409 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 KCNQ3O43525 872 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 PLIN1O60240 522 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM37O94972 964 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 TSPYL6Q8N831 410 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 A0A087WZG4 1122 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 KRT24Q2M2I5 525 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 AK7Q96M32 723 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 ATRNO75882 1429 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 BAG6P46379 1132 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRO-210ENST00000544244 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PDE3AQ14432 1141 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 SIK1P57059 783 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ARID3AQ99856 593 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ATG3Q9NT62 314 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PTPRCP08575 1304 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 FLIIQ13045 1269 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ERBB4Q15303 1308 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 KCNQ2O43526 872 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 POTEAQ6S8J7 498 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 COG6Q9Y2V7 657 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PALLDQ8WX93 1383 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ZPR1O75312 459 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 USP16Q9Y5T5 823 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 DISP2A7MBM2 1401 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ANXA1P04083 346 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 NBPF14Q5TI25 921 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 COPS6Q7L5N1 327 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PANK1Q8TE04 598 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 A1BGP04217 495 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 AAMPQ13685 434 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 CRBNQ96SW2 442 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 GNAI3P08754 354 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 BCL11AQ9H165 835 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 COL18A1P39060 1754 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 RFC4P35249 363 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 STK32BQ9NY57 414 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 GNPATO15228 680 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 HMMRO75330 724 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 KSR2Q6VAB6 950 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-210ENST00000544244 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.11□□□□□ -1.27
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