RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542338.1

NPIPB4-216, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 387 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-216	ENST00000542338	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NPIPB4-216	ENST00000542338	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NPIPB4-216	ENST00000542338	KIF16B	Q96L93	1317 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NPIPB4-216	ENST00000542338	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NPIPB4-216	ENST00000542338	BTAF1	O14981	1849 aa		12.02	□□□□□ -0.48
NPIPB4-216	ENST00000542338	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.02	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		12.02	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		12.02	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	KCNQ3	O43525	872 aa		12.01	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	KCNQ2	O43526	872 aa		12.01	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.01	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.01	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	CAPN15	O75808	1086 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	BCAR3	O75815	825 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	PDE3A	Q14432	1141 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	TXNRD1	Q16881	649 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	STK32B	Q9NY57	414 aa		12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	STARD3NL	O95772	234 aa		11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	PTPRC	P08575	1304 aa		11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.98	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NPIPB4-216	ENST00000542338	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	LY75	O60449	1722 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	YY1	P25490	414 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	AAMP	Q13685	434 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	PROM2	Q8N271	834 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	PLIN1	O60240	522 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	SIK1	P57059	783 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	ITGB4	P16144	1822 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	FLII	Q13045	1269 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	FKBP8	Q14318	412 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	TRIM27	P14373	513 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	PTGER2	P43116	358 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	PDIA6	Q15084	440 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	C5	P01031	1676 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NPIPB4-216	ENST00000542338	A1BG	P04217	495 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NPIPB4-216	ENST00000542338	MYL6B	P14649	208 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NPIPB4-216	ENST00000542338	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NPIPB4-216	ENST00000542338	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NPIPB4-216	ENST00000542338	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NPIPB4-216	ENST00000542338	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NPIPB4-216	ENST00000542338	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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