RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ANXA1P04083 346 aa25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 LNPKQ9C0E8 428 aa25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 C8orf37Q96NL8 207 aa25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TNS2Q63HR2 1409 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC5O00471 708 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PROSER3Q2NL68 480 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 NGLY1Q96IV0 654 aa25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PDIA6Q15084 440 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 USP16Q9Y5T5 823 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-211ENST00000539589 BARGINQ6ZT62 677 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DCTPP1Q9H773 170 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MEIS3Q99687 375 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGBQ92521 554 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS72Q15906 364 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DDB1Q16531 1140 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP10DQ9P241 1426 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC4A3P48751 1232 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 NBR1Q14596 966 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP85Q6P2H3 762 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCY9O60503 1353 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 HYPKQ9NX55 129 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.2■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.2■■□□□ 1.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL9O00512 1426 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 USP21Q9UK80 565 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 BECN1Q14457 450 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG3Q9NT62 314 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 HMMRO75330 724 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL6BP14649 208 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 BEND3Q5T5X7 828 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 GNAI2P04899 355 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 KSR2Q6VAB6 950 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 GNAI3P08754 354 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 USP44Q9H0E7 712 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF26B4DH59 902 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF14Q5TI25 921 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF15Q8N660 670 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 COPS6Q7L5N1 327 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 AFF2P51816 1311 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 A1BGP04217 495 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 ERBB4Q15303 1308 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-211ENST00000539589 TJP1Q07157 1748 aa25.06■■□□□ 1.6
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