RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536072.6

EDC4-202, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 2

Gene EDC4, Length 2,375 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-202ENST00000536072 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.871e-6■■□□□ 11.7
EDC4-202ENST00000536072 SLAIN2Q9P270 581 aa20.48■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.48■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.47■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.47■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 CYP27B1O15528 508 aa20.46■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 HSCBQ8IWL3 235 aa20.46■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 SSH3Q8TE77 659 aa20.46■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.46■□□□□ 0.87
EDC4-202ENST00000536072 ABCC6O95255 1503 aa20.45■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.45■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.45■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 KSR2Q6VAB6 950 aa20.44■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.44■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 HYPKQ9NX55 129 aa20.44■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 SRGAP3O43295 1099 aa20.43■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 POLA2Q14181 598 aa20.43■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 PDIA6Q15084 440 aa20.43■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 DCAF5Q96JK2 942 aa20.43■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 MX1P20591 662 aa20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 SNX21Q969T3 373 aa20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 CASC1Q6TDU7 716 aa20.42■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 MYL6BP14649 208 aa20.4■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 USP26Q9BXU7 913 aa20.4■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 ALDH1L1O75891 902 aa20.39■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.39■□□□□ 0.86
EDC4-202ENST00000536072 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.39■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 C5P01031 1676 aa20.39■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 RAB11FIP3O75154 756 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 CABP4P57796 275 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 STAP2Q9UGK3 403 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 USP16Q9Y5T5 823 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 MRC1P22897 1456 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 LINS1Q8NG48 757 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 ERC2O15083 957 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 RILPL2Q969X0 211 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 COPS6Q7L5N1 327 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 GRM8O00222 908 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 REC8O95072 547 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 MTX1Q13505 466 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 STRN4Q9NRL3 753 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 IGKV5-2P06315 115 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-202ENST00000536072 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 SUCLG2Q96I99 432 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 KAZALD1Q96I82 304 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 AOX1Q06278 1338 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 RABEP1Q15276 862 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 MYD88Q99836 296 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 UTYO14607 1347 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 CHMLP26374 656 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 DDIT3P35638 169 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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EDC4-202ENST00000536072 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 IL2RBP14784 551 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 EVA1CP58658 441 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-202ENST00000536072 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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