RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527251.5

BBS1-212, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 3

Gene BBS1, Length 1,034 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-212ENST00000527251 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.08■■□□□ 1.29
BBS1-212ENST00000527251 COL15A1P39059 1388 aa23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 KCNA3P22001 575 aa23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 PPP2R1AP30153 589 aa23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 TM4SF1P30408 202 aa23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.07■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.06■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.06■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 NARFQ9UHQ1 456 aa23.06■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 STARD3NLO95772 234 aa23.05■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 IFFO2Q5TF58 517 aa23.05■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 ZNF790Q6PG37 636 aa23.05■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 NUDCQ9Y266 331 aa23.05■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 CHRNA5P30532 468 aa23.03■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 NFIXQ14938 502 aa23.03■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 PIM2Q9P1W9 311 aa23.03■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.02■■□□□ 1.28
BBS1-212ENST00000527251 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.01■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.01■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 KCNQ3O43525 872 aa23■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 BTBD11A6QL63 1104 aa22.99■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.99■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.98■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.97■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 A0A087WZG4 1122 aa22.97■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 SERPINB2P05120 415 aa22.97■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 MCM10Q7L590 875 aa22.97■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 HSPA6P17066 643 aa22.96■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.96■■□□□ 1.27
BBS1-212ENST00000527251 A1BGP04217 495 aa22.95■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.95■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 DCTN1Q14203 1278 aa22.94■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 KIF3CO14782 793 aa22.93■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.93■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.93■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.91■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 USP16Q9Y5T5 823 aa22.91■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.9■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.9■■□□□ 1.26
BBS1-212ENST00000527251 RNF181Q9P0P0 153 aa22.89■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 SCN7AQ01118 1682 aa22.88■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 H0YIN7 160 aa22.88■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.88■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.88■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 CAMTA2O94983 1202 aa22.87■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 TTLL6Q8N841 843 aa22.87■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 RASSF7Q02833 373 aa22.86■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.86■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 NEFMP07197 916 aa22.85■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.85■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 SETDB2Q96T68 719 aa22.85■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.84■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 SBF1O95248 1867 aa22.84■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 NPHP1O15259 732 aa22.83■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.83■■□□□ 1.25
BBS1-212ENST00000527251 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.82■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 TOMM70O94826 608 aa22.82■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 PDE6BP35913 854 aa22.82■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 APLP1P51693 650 aa22.81■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 CNBD1Q8NA66 436 aa22.81■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.81■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 NBPF26B4DH59 902 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 NBPF15Q8N660 670 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 BCORQ6W2J9 1755 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 PRELPP51888 382 aa22.79■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 LMNB1P20700 586 aa22.78■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 ST5P78524 1137 aa22.78■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 NFE2L2Q16236 605 aa22.78■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 RRAGCQ9HB90 399 aa22.78■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.78■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.77■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.77■■□□□ 1.24
BBS1-212ENST00000527251 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.77■■□□□ 1.24
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