RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 CANXP27824 592 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 FKBP8Q14318 412 aa35.35■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.35■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZPR1O75312 459 aa35.34■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 COL15A1P39059 1388 aa35.34■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.33■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 NFE2L2Q16236 605 aa35.33■■■■□ 3.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 NARFQ9UHQ1 456 aa35.32■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF13BQ9NQT8 1826 aa35.32■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.31■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 GRIN3BO60391 1043 aa35.3■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 EIF5P55010 431 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 C10orf71Q711Q0 1435 aa35.26■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 TM4SF1P30408 202 aa35.26■■■■□ 3.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 A1BGP04217 495 aa35.25■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 DDR1Q08345 913 aa35.25■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 A0A087WZG4 1122 aa35.24■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 TGFB2P61812 414 aa35.24■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.24■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 USP16Q9Y5T5 823 aa35.24■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.23■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 WWC3Q9ULE0 1092 aa35.23■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.23■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.22■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.21■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIPK4P57078 832 aa35.19■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 NFIXQ14938 502 aa35.19■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 A0A0G2JLW4 131 aa35.18■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.18■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.18■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 UTRNP46939 3433 aa35.17■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 DPEP1P16444 411 aa35.16■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa35.16■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.15■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.13■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 SCN7AQ01118 1682 aa35.11■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 RUNDC1Q96C34 613 aa35.11■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 NRXN2Q9P2S2 1712 aa35.1■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 SERPINB2P05120 415 aa35.1■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.1■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.1■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 BCS1LQ9Y276 419 aa35.09■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.08■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCNA3P22001 575 aa35.08■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.08■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
RPS6KA1-212ENST00000526040 NBPF26B4DH59 902 aa35.07■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 CAMTA2O94983 1202 aa35.07■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 NEUROD2Q15784 382 aa35.07■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 NBPF15Q8N660 670 aa35.07■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.05■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 BCORQ6W2J9 1755 aa35.05■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 PIM2Q9P1W9 311 aa35.04■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHRNA5P30532 468 aa35.03■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.01■■■■□ 3.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 SETDB2Q96T68 719 aa34.99■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRIM35Q9UPQ4 493 aa34.99■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa34.98■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.98■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.97■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.96■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa34.95■■■■□ 3.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRR5LQ6MZQ0 368 aa34.93■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 RGL2O15211 777 aa34.92■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 NGEFQ8N5V2 710 aa34.92■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.92■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC184Q52MB2 194 aa34.91■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 C2CD5Q86YS7 1000 aa34.91■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.91■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 H0YIN7 160 aa34.9■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHL1O00533 1208 aa34.9■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.9■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.9■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 APAF1O14727 1248 aa34.89■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 NPHP1O15259 732 aa34.89■■■■□ 3.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYL6BP14649 208 aa34.89■■■■□ 3.18
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