RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 USP16Q9Y5T5 823 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 C5P01031 1676 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 F6X3S4 739 aa26.48■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.48■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 BCL9O00512 1426 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 ATRNO75882 1429 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 GLI3P10071 1580 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 PAPPAQ13219 1627 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 PROSER3Q2NL68 480 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 ATG3Q9NT62 314 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 AAMPQ13685 434 aa26.45■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 PDIA6Q15084 440 aa26.43■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
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CLDN23-201ENST00000519106 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 MYL6BP14649 208 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 HYPKQ9NX55 129 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CLDN23-201ENST00000519106 KCNQ2O43526 872 aa26.39■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 FAM182BQ5T319 152 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 IGHDP01880 384 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 FBXO41Q8TF61 875 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 A1BGP04217 495 aa26.34■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.34■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.34■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.34■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 ADCY9O60503 1353 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 NBPF26B4DH59 902 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 NBPF14Q5TI25 921 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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CLDN23-201ENST00000519106 COPS6Q7L5N1 327 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 NBPF15Q8N660 670 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 KSR2Q6VAB6 950 aa26.31■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 MEIS3Q99687 375 aa26.31■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 ERBB4Q15303 1308 aa26.3■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 STARD3NLO95772 234 aa26.29■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.29■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.29■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 BEND3Q5T5X7 828 aa26.27■■□□□ 1.8
CLDN23-201ENST00000519106 PALLDQ8WX93 1383 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 SIK1P57059 783 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 ATP6V1AP38606 617 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 USP44Q9H0E7 712 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 ATP10DQ9P241 1426 aa26.22■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.22■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 SKAP1Q86WV1 359 aa26.22■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 GNAI3P08754 354 aa26.21■■□□□ 1.79
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CLDN23-201ENST00000519106 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.21■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 TJP1Q07157 1748 aa26.21■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.2■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 EP400Q96L91 3159 aa26.2■■□□□ 1.79
CLDN23-201ENST00000519106 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 LINS1Q8NG48 757 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 NHSQ6T4R5 1651 aa26.19■■□□□ 1.78
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