RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517345.5

LINC02055-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2055, humanhuman

TSL 3

Gene LINC02055, Length 439 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02055-201ENST00000517345 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.79□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 SEMA3FQ13275 785 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 C4orf17Q53FE4 359 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 ARTNQ5T4W7 220 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 ALG2Q9H553 416 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.78□□□□□ -1.32
LINC02055-201ENST00000517345 BTBD11A6QL63 1104 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ARAFP10398 606 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 EFHC2Q5JST6 749 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 PLVAPQ9BX97 442 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ZMYND15Q9H091 742 aa6.77□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ZNF592Q92610 1267 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 KLF15Q9UIH9 416 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 DYRK3O43781 588 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 SOX11P35716 441 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 NBPF11Q86T75 865 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 PIK3CDO00329 1044 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 GNASQ5JWF2 1037 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 RNF20Q5VTR2 975 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 HCN2Q9UL51 889 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 GNRH1P01148 92 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 C14orf37Q86TY3 774 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 CCDC125Q86Z20 511 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 GLMNQ92990 594 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC02055-201ENST00000517345 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 CD33P20138 364 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 ADH6P28332 368 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 XAGE2Q96GT9 111 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 FAM229AH3BQW9 127 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 UCN2Q96RP3 112 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 SKIP12755 728 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PLA2G4AP47712 749 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 ARID3CA6NKF2 412 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 APBA3O96018 575 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 ATP4AP20648 1035 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 TNP2Q05952 138 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 USP17L5A8MUK1 530 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 ATP9BO43861 1147 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 USP4Q13107 963 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 TLR1Q15399 786 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 AIDAQ96BJ3 306 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02055-201ENST00000517345 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 NCOA4Q13772 614 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 LRP8Q14114 963 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 GRIK4Q16099 956 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 FAM182BQ5T319 152 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02055-201ENST00000517345 A0A1W2PNR3 127 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms