RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF76P36508 570 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 EVI5LQ96CN4 794 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPRKQ15262 1439 aa20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 MYO6Q9UM54 1294 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 TEX35Q5T0J7 233 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF213O14771 459 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 CAGE1Q8TC20 777 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 CBFA2T2O43439 604 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 ABCC2Q92887 1545 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM83GA6ND36 823 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 IL27Q8NEV9 243 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR62O43379 1518 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 FLT4P35916 1363 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 RFC4P35249 363 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 TBX22Q9Y458 520 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 C6orf229H3BNL8 230 aa20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX11Q96FC9 970 aa20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 ALDH1L1O75891 902 aa20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 TNIP1Q15025 636 aa20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 ZMYM3Q14202 1370 aa20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.42■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 121.2
PTDSS1-202ENST00000517309 TRPM2O94759 1503 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 BAG3O95817 575 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 NPATQ14207 1427 aa20.41■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 SMTNL1A8MU46 457 aa20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 MCM4P33991 863 aa20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 ST5P78524 1137 aa20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.4■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 DDB1Q16531 1140 aa20.39■□□□□ 0.86
PTDSS1-202ENST00000517309 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 C8orf76Q96K31 380 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 NBPF4Q96M43 638 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 DEF6Q9H4E7 631 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 POLKQ9UBT6 870 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 RAB34Q9BZG1 259 aa20.39■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 IL2RBP14784 551 aa20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLIM4O00461 696 aa20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFYVE9O95405 1425 aa20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 KSR2Q6VAB6 950 aa20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 MAP3K11Q16584 847 aa20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms