RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAPPC3LQ5T215 181 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADAM32Q8TC27 787 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSC1Q92574 1164 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC102AQ96A19 550 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRRG2O14669 202 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERVK-9P63128 1117 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CFAP44Q96MT7 982 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 MDFIQ99750 246 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 TBC1D2Q9BYX2 928 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADGRE2Q9UHX3 823 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A0A0MRY4 1105 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 GNRH1P01148 92 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAPTP10636 758 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPINK2P20155 84 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 TNP2Q05952 138 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF20Q5VTR2 975 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 LILRB5O75023 590 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM157BP0CG42 384 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 TNFRSF25Q93038 417 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 NEUROD1Q13562 356 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 DTX1Q86Y01 620 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 WFDC12Q8WWY7 111 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 BEGAINQ9BUH8 593 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 MARK1Q9P0L2 795 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 B8ZZF3 427 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD33P20138 364 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHKA2P46019 1235 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CENPCQ03188 943 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 PKN1Q16512 942 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 C4orf17Q53FE4 359 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 SAMD5Q5TGI4 173 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CABLES1Q8TDN4 633 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF592Q92610 1267 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNKSR1Q969H4 720 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-162P-201ENST00000516228 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAK2O60296 914 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 LILRB3O75022 631 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGLV1-40P01703 118 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALBP02768 609 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 LILRA6Q6PI73 481 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYT9Q86SS6 491 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZIC5Q96T25 663 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCDC2BA2VCK2 349 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 MED26O95402 600 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ESCO1Q5FWF5 840 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 SHISA2Q6UWI4 295 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSRNP1Q96S65 589 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 XAGE2Q96GT9 111 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 STARD13Q9Y3M8 1113 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 HRH3Q9Y5N1 445 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 GJA3Q9Y6H8 435 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 TGFB1P01137 390 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 NOS3P29474 1203 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADH7P40394 386 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCAF11Q8TEB1 546 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1W2PNR3 127 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 EFSO43281 561 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL2RAP01589 272 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 TATP17735 454 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ITGB5P18084 799 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 QPCTQ16769 361 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 NBPF1Q3BBV0 1214 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 CBLL1Q75N03 491 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 FBXO11Q86XK2 927 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms