RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 USP16Q9Y5T5 823 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM182BQ5T319 152 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 CACNA1FO60840 1977 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 RGS12O14924 1447 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 FLIIQ13045 1269 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 PDIA6Q15084 440 aa14.67□□□□□ -0.06
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SLC13A3-211ENST00000495082 HYPKQ9NX55 129 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 PALLDQ8WX93 1383 aa14.67□□□□□ -0.06
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SLC13A3-211ENST00000495082 G2E3Q7L622 706 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 PANK1Q8TE04 598 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 TNNQ9UQP3 1299 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 ABCC4O15439 1325 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 CRBNQ96SW2 442 aa14.65□□□□□ -0.06
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SLC13A3-211ENST00000495082 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC13A3-211ENST00000495082 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 STARD3NLO95772 234 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 SIK1P57059 783 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 PROSER3Q2NL68 480 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.64□□□□□ -0.07
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SLC13A3-211ENST00000495082 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 SBF2Q86WG5 1849 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 COG6Q9Y2V7 657 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 ANXA1P04083 346 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 AAMPQ13685 434 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 BTAF1O14981 1849 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 TJP1Q07157 1748 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 NBPF26B4DH59 902 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 NBPF14Q5TI25 921 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 NBPF15Q8N660 670 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 EP400Q96L91 3159 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 A1BGP04217 495 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP6V1AP38606 617 aa14.61□□□□□ -0.07
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SLC13A3-211ENST00000495082 ADCY9O60503 1353 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 F6X3S4 739 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 ITPK1Q13572 414 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 KSR2Q6VAB6 950 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-211ENST00000495082 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-211ENST00000495082 TRIM37O94972 964 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 COPS6Q7L5N1 327 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP10DQ9P241 1426 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 LY75O60449 1722 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 RREB1Q92766 1687 aa14.56□□□□□ -0.08
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SLC13A3-211ENST00000495082 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.56□□□□□ -0.08
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SLC13A3-211ENST00000495082 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.55□□□□□ -0.08
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SLC13A3-211ENST00000495082 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 BEND3Q5T5X7 828 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-211ENST00000495082 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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