RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 USPL1Q5W0Q7 1092 aa30.39■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.39■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.38■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 NARFQ9UHQ1 456 aa30.38■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa30.38■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SBF1O95248 1867 aa30.37■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.35■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF3CO14782 793 aa30.35■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC5Q8N0Z6 440 aa30.35■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 GNAT3A8MTJ3 354 aa30.34■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TRDMT1-211ENST00000495022 HSPA6P17066 643 aa30.32■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 TEFQ10587 303 aa30.32■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 STARD3NLO95772 234 aa30.31■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 NFIXQ14938 502 aa30.31■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 IL17REQ8NFR9 667 aa30.31■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 CHRNA5P30532 468 aa30.29■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF790Q6PG37 636 aa30.29■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP53Q96M91 514 aa30.29■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 SCN7AQ01118 1682 aa30.29■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL2L12Q9HB09 334 aa30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF5P55010 431 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.27■■■□□ 2.44
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A087WZG4 1122 aa30.26■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30.25■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 SERPINB2P05120 415 aa30.24■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKAR2BP31323 418 aa30.24■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.23■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 NUDCQ9Y266 331 aa30.23■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.23■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.23■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 TOMM70O94826 608 aa30.22■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.22■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.2■■■□□ 2.43
TRDMT1-211ENST00000495022 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 BCORQ6W2J9 1755 aa30.19■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF181Q9P0P0 153 aa30.19■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP2R1AP30153 589 aa30.17■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 BTBD11A6QL63 1104 aa30.16■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CARMIL3Q8ND23 1372 aa30.16■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 BICDL1Q6ZP65 573 aa30.15■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.15■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D9BQ66K14 1250 aa30.15■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL6Q8N841 843 aa30.15■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
TRDMT1-211ENST00000495022 H0YIN7 160 aa30.14■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 C2CD5Q86YS7 1000 aa30.14■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.14■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 APLP1P51693 650 aa30.13■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.13■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.12■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNQ3O43525 872 aa30.12■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 A1BGP04217 495 aa30.12■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.12■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 RASSF7Q02833 373 aa30.1■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.1■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 BRIP1Q9BX63 1249 aa30.09■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 CACNA1SQ13698 1873 aa30.09■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR90Q96KV7 1748 aa30.08■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMTA2O94983 1202 aa30.08■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 LMNB1P20700 586 aa30.08■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE6BP35913 854 aa30.08■■■□□ 2.41
TRDMT1-211ENST00000495022 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.07■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 PRR5LQ6MZQ0 368 aa30.07■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 MCM10Q7L590 875 aa30.07■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 SETDB2Q96T68 719 aa30.06■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 USP16Q9Y5T5 823 aa30.06■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.05■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 FSTL1Q12841 308 aa30.03■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 CNBD1Q8NA66 436 aa30.03■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 RRAGCQ9HB90 399 aa30.03■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 PRELPP51888 382 aa30.03■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 SLX4Q8IY92 1834 aa30.02■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 NFKBIEO00221 500 aa30.02■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.02■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.01■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 DCTN1Q14203 1278 aa30.01■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.01■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 ST5P78524 1137 aa30■■■□□ 2.39
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