RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 FCHSD2O94868 740 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 NARFQ9UHQ1 456 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 CEP350Q5VT06 3117 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 STARD3NLO95772 234 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 TM4SF1P30408 202 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 KCNA3P22001 575 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 IL17REQ8NFR9 667 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 PIM2Q9P1W9 311 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 NUDCQ9Y266 331 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 SCN7AQ01118 1682 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 PRKAR2BP31323 418 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF790Q6PG37 636 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-208ENST00000493601 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 NFIXQ14938 502 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 PPP2R1AP30153 589 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 A0A087WZG4 1122 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 CHRNA5P30532 468 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-208ENST00000493601 BTBD11A6QL63 1104 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 KIF3CO14782 793 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 SERPINB2P05120 415 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 BCORQ6W2J9 1755 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 SBF1O95248 1867 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 HSPA6P17066 643 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-208ENST00000493601 MCM10Q7L590 875 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 RNF181Q9P0P0 153 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 KCNQ3O43525 872 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 A1BGP04217 495 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 H0YIN7 160 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 TTLL6Q8N841 843 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 NEFMP07197 916 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 TOMM70O94826 608 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 CAMTA2O94983 1202 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 SETDB2Q96T68 719 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 PDE6BP35913 854 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 DCTN1Q14203 1278 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 USP16Q9Y5T5 823 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-208ENST00000493601 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 NPHP1O15259 732 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 RASSF7Q02833 373 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 CNBD1Q8NA66 436 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 LMNB1P20700 586 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 ST5P78524 1137 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 CACNA1SQ13698 1873 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 APLP1P51693 650 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 RGL2O15211 777 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.02■■□□□ 1.12
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