RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.49■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 FKBP8Q14318 412 aa22.48■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 DDR1Q08345 913 aa22.46■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 ZNF790Q6PG37 636 aa22.46■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.46■■□□□ 1.19
AGRN-209ENST00000492947 TM4SF1P30408 202 aa22.45■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 TGFB2P61812 414 aa22.44■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 KCNA3P22001 575 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 TEFQ10587 303 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 KCNQ3O43525 872 aa22.42■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 COL15A1P39059 1388 aa22.41■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 NARFQ9UHQ1 456 aa22.41■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 ADCY9O60503 1353 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-209ENST00000492947 A0A0G2JLW4 131 aa22.39■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 DPEP1P16444 411 aa22.38■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.38■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 STARD3NLO95772 234 aa22.37■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 MCM10Q7L590 875 aa22.37■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.37■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 BTBD11A6QL63 1104 aa22.36■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 NFIXQ14938 502 aa22.36■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.36■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.35■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 ZPR1O75312 459 aa22.35■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 DCTN1Q14203 1278 aa22.35■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
AGRN-209ENST00000492947 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.32■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 A1BGP04217 495 aa22.32■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 USP16Q9Y5T5 823 aa22.32■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 ATP10DQ9P241 1426 aa22.31■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 BCS1LQ9Y276 419 aa22.29■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 SCN7AQ01118 1682 aa22.29■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 A0A087WZG4 1122 aa22.28■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 CHRNA5P30532 468 aa22.28■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 C1QTNF8P60827 252 aa22.28■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 NFE2L2Q16236 605 aa22.28■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 CAMTA2O94983 1202 aa22.27■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 SLC4A2P04920 1241 aa22.27■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 SERPINB2P05120 415 aa22.27■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 PIM2Q9P1W9 311 aa22.27■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.27■■□□□ 1.16
AGRN-209ENST00000492947 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.26■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.26■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.26■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.26■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 NBPF26B4DH59 902 aa22.25■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 NBPF15Q8N660 670 aa22.25■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.25■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.24■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.23■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 BCORQ6W2J9 1755 aa22.22■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.21■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 RIPK4P57078 832 aa22.21■■□□□ 1.15
AGRN-209ENST00000492947 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.2■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.2■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 RUNDC1Q96C34 613 aa22.2■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 ANP32CO43423 234 aa22.19■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.19■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.19■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 RGL2O15211 777 aa22.18■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.17■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.17■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.16■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.5 ms