RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A087WWV3	80 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	LIG1	P18858	919 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF20A	O95235	890 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	IL13	P35225	146 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	MNS1	Q8NEH6	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ANAPC15	P60006	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	AACS	Q86V21	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	LARGE1	O95461	756 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	SKIL	P12757	684 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPRC	P08575	1304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ME1	P48163	572 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCA8	O94911	1581 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	BIN1	O00499	593 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PDC	P20941	246 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CUL4A	Q13619	759 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ELF2	Q15723	593 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PDE4C	Q08493	712 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	IL25	Q9H293	177 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CLTCL1	P53675	1640 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	CHD1	O14646	1710 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMA5	P28066	241 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PDILT	Q8N807	584 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	FANCA	O15360	1455 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		11.58	□□□□□ -0.55
ERCC3-208	ENST00000491292	HSPA4	P34932	840 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	TEF	Q10587	303 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	AP5Z1	O43299	807 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	FEZ1	Q99689	392 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
ERCC3-208	ENST00000491292	TPM4	P67936	248 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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