RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF3CO14782 793 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 COL15A1P39059 1388 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 IL17REQ8NFR9 667 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 HSPA6P17066 643 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 STARD3NLO95772 234 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 CHRNA5P30532 468 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 TEFQ10587 303 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 NFIXQ14938 502 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 SBF1O95248 1867 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF790Q6PG37 636 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 CFAP53Q96M91 514 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A087WZG4 1122 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 SERPINB2P05120 415 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 TOMM70O94826 608 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 PRKAR2BP31323 418 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 NUDCQ9Y266 331 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF181Q9P0P0 153 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 SCN7AQ01118 1682 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 BTBD11A6QL63 1104 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP2R1AP30153 589 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 TTLL6Q8N841 843 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 A1BGP04217 495 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 H0YIN7 160 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNQ3O43525 872 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 APLP1P51693 650 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 RASSF7Q02833 373 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 USP16Q9Y5T5 823 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 BCORQ6W2J9 1755 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 CAMTA2O94983 1202 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 LMNB1P20700 586 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE6BP35913 854 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 MCM10Q7L590 875 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 SETDB2Q96T68 719 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 RRAGCQ9HB90 399 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 FSTL1Q12841 308 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 PRELPP51888 382 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 NFKBIEO00221 500 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 DCTN1Q14203 1278 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 WDR90Q96KV7 1748 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 GLTPD2A6NH11 291 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 CNBD1Q8NA66 436 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 ST5P78524 1137 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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