RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488711.1

EHD1-210, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-210ENST00000488711 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
EHD1-210ENST00000488711 DCTN1Q14203 1278 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-210ENST00000488711 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-210ENST00000488711 BTBD11A6QL63 1104 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 DDR1Q08345 913 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 ZPR1O75312 459 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 A0A0G2JLW4 131 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 STARD3NLO95772 234 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 NARFQ9UHQ1 456 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 TGFB2P61812 414 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-210ENST00000488711 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 DPEP1P16444 411 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 TM4SF1P30408 202 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 RALBP1Q15311 655 aa27■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 PLEKHF1Q96S99 279 aa27■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 A1BGP04217 495 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 NEFMP07197 916 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 NFIXQ14938 502 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 BCS1LQ9Y276 419 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 USP16Q9Y5T5 823 aa26.96■■□□□ 1.91
EHD1-210ENST00000488711 KCNA3P22001 575 aa26.95■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.95■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.95■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.94■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 A0A087WZG4 1122 aa26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 NFE2L2Q16236 605 aa26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.92■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 CHRNA5P30532 468 aa26.92■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 SERPINB2P05120 415 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 SCN7AQ01118 1682 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 ATP10DQ9P241 1426 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-210ENST00000488711 ADCY9O60503 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 PIM2Q9P1W9 311 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 CAMTA2O94983 1202 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 NBPF26B4DH59 902 aa26.84■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 NBPF15Q8N660 670 aa26.84■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 BCORQ6W2J9 1755 aa26.83■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.83■■□□□ 1.89
EHD1-210ENST00000488711 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 RIPK4P57078 832 aa26.82■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.82■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.82■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.81■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 C1QTNF8P60827 252 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 SETDB2Q96T68 719 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.76■■□□□ 1.88
EHD1-210ENST00000488711 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 NEUROD2Q15784 382 aa26.76■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.75■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 H0YIN7 160 aa26.74■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 NGEFQ8N5V2 710 aa26.74■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.74■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 CNBD1Q8NA66 436 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 NPHP1O15259 732 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 RUNDC1Q96C34 613 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 TTLL6Q8N841 843 aa26.71■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.71■■□□□ 1.87
EHD1-210ENST00000488711 PDE6BP35913 854 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms