RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485686.2

ZHX3-209, Transcript of zinc fingers and homeoboxes 3, human

TSL 3

Gene ZHX3, Length 255 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZHX3-209	ENST00000485686	FGD1	P98174	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	OPLAH	O14841	1288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	IGBP1	P78318	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	FOXK2	Q01167	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ORC1	Q13415	861 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	STIM2	Q9P246	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ARHGAP33	O14559	1287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	ENPP3	O14638	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	HSD3B2	P26439	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	KCNH8	Q96L42	1107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZHX3-209	ENST00000485686		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	TLL1	O43897	1013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	NR1I2	O75469	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	GDF10	P55107	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PAK2	Q13177	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	BAP1	Q92560	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SPSB2	Q99619	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PDGFA	P04085	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	RAB15	P59190	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	CBLB	Q13191	982 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	AAMP	Q13685	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	MYO19	Q96H55	970 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	INHA	P05111	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ITGAE	P38570	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	EDEM1	Q92611	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686		A6NHS1	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZHX3-209	ENST00000485686	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms