RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 CEP350Q5VT06 3117 aa29.76■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 HSPA6P17066 643 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 TEFQ10587 303 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 KIF3CO14782 793 aa29.74■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 CFAP53Q96M91 514 aa29.73■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 NFIXQ14938 502 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 A0A087WZG4 1122 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 CHRNA5P30532 468 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 IL17REQ8NFR9 667 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPRN-215ENST00000484986 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF790Q6PG37 636 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 NUDCQ9Y266 331 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 TOMM70O94826 608 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 SERPINB2P05120 415 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRN-215ENST00000484986 PRKAR2BP31323 418 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 RNF181Q9P0P0 153 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 BTBD11A6QL63 1104 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 H0YIN7 160 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 TTLL6Q8N841 843 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRN-215ENST00000484986 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 APLP1P51693 650 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 PPP2R1AP30153 589 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 LMNB1P20700 586 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 PDE6BP35913 854 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRN-215ENST00000484986 A1BGP04217 495 aa29.51■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 SETDB2Q96T68 719 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 KCNQ3O43525 872 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 RASSF7Q02833 373 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 FSTL1Q12841 308 aa29.48■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 NPHP1O15259 732 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 CAMTA2O94983 1202 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 MCM10Q7L590 875 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 CNBD1Q8NA66 436 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
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PTPRN-215ENST00000484986 USP16Q9Y5T5 823 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 SCN7AQ01118 1682 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.45■■■□□ 2.31
PTPRN-215ENST00000484986 NEFMP07197 916 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 ST5P78524 1137 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 SBF1O95248 1867 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 GLTPD2A6NH11 291 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 NFKBIEO00221 500 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 RGL2O15211 777 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 CNKSR1Q969H4 720 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 DCTN1Q14203 1278 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRN-215ENST00000484986 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 PRELPP51888 382 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 IFFO2Q5TF58 517 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 STYK1Q6J9G0 422 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRN-215ENST00000484986 C21orf2O43822 256 aa29.37■■■□□ 2.29
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