RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
PTPRD-210ENST00000481079 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.83■■■□□ 2.69
PTPRD-210ENST00000481079 COL15A1P39059 1388 aa31.82■■■□□ 2.69
PTPRD-210ENST00000481079 FMNL2Q96PY5 1086 aa31.82■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 STARD3NLO95772 234 aa31.81■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 C10orf71Q711Q0 1435 aa31.81■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 EIF5P55010 431 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 DDR1Q08345 913 aa31.78■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 NFE2L2Q16236 605 aa31.78■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.78■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 NARFQ9UHQ1 456 aa31.78■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 NEFMP07197 916 aa31.77■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.77■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.77■■■□□ 2.68
PTPRD-210ENST00000481079 ZPR1O75312 459 aa31.76■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 TM4SF1P30408 202 aa31.76■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.76■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa31.73■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 GRIN3BO60391 1043 aa31.73■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.73■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.72■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 A1BGP04217 495 aa31.72■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 USP16Q9Y5T5 823 aa31.72■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 TGFB2P61812 414 aa31.71■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 MIS18AQ9NYP9 233 aa31.7■■■□□ 2.67
PTPRD-210ENST00000481079 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
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PTPRD-210ENST00000481079 SCN7AQ01118 1682 aa31.69■■■□□ 2.66
PTPRD-210ENST00000481079 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
PTPRD-210ENST00000481079 NFIXQ14938 502 aa31.68■■■□□ 2.66
PTPRD-210ENST00000481079 NRXN2Q9P2S2 1712 aa31.68■■■□□ 2.66
PTPRD-210ENST00000481079 A0A087WZG4 1122 aa31.67■■■□□ 2.66
PTPRD-210ENST00000481079 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
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PTPRD-210ENST00000481079 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
PTPRD-210ENST00000481079 DPEP1P16444 411 aa31.64■■■□□ 2.66
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PTPRD-210ENST00000481079 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
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PTPRD-210ENST00000481079 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
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PTPRD-210ENST00000481079 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.6■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.6■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 NBPF26B4DH59 902 aa31.59■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 CAMTA2O94983 1202 aa31.59■■■□□ 2.65
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PTPRD-210ENST00000481079 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.58■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 TBC1D9BQ66K14 1250 aa31.58■■■□□ 2.65
PTPRD-210ENST00000481079 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 SERPINB2P05120 415 aa31.57■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 RUNDC1Q96C34 613 aa31.56■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 CHRNA5P30532 468 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 BCS1LQ9Y276 419 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 CARMIL3Q8ND23 1372 aa31.53■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa31.52■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.52■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.52■■■□□ 2.64
PTPRD-210ENST00000481079 PIM2Q9P1W9 311 aa31.51■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 NEUROD2Q15784 382 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 ADCY9O60503 1353 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.49■■■□□ 2.63
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PTPRD-210ENST00000481079 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.46■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC184Q52MB2 194 aa31.45■■■□□ 2.63
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PTPRD-210ENST00000481079 SETDB2Q96T68 719 aa31.45■■■□□ 2.63
PTPRD-210ENST00000481079 ATP10DQ9P241 1426 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 RGL2O15211 777 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 CHL1O00533 1208 aa31.42■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.41■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC24Q8N4L8 307 aa31.41■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 HLFQ16534 295 aa31.4■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 C2CD5Q86YS7 1000 aa31.4■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.4■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.4■■■□□ 2.62
PTPRD-210ENST00000481079 ERBB4Q15303 1308 aa31.39■■■□□ 2.62
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