RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	TGFB2	P61812	414 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	RALBP1	Q15311	655 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	COL15A1	P39059	1388 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	DDR1	Q08345	913 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	NARF	Q9UHQ1	456 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	TM4SF1	P30408	202 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		27.76	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A0G2JLW4	131 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	NEFM	P07197	916 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	DPEP1	P16444	411 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	NFIX	Q14938	502 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A087WZG4	1122 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	A1BG	P04217	495 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
CTBP2-208	ENST00000476817	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	KCNA3	P22001	575 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	BCS1L	Q9Y276	419 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	SERPINB2	P05120	415 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CTBP2-208	ENST00000476817	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	CHRNA5	P30532	468 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	ADCY9	O60503	1353 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	ATP10D	Q9P241	1426 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CTBP2-208	ENST00000476817	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	RIPK4	P57078	832 aa		27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.57	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.56	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.53	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.53	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.52	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.52	■■■□□ 2
CTBP2-208	ENST00000476817	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.51	■■□□□ 1.99	1e-5	■■□□□ 14.2
CTBP2-208	ENST00000476817	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817		H0YIN7	160 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	RGL2	O15211	777 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CTBP2-208	ENST00000476817	PDE6B	P35913	854 aa		27.45	■■□□□ 1.98
CTBP2-208	ENST00000476817	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.45	■■□□□ 1.98
CTBP2-208	ENST00000476817	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.45	■■□□□ 1.98
CTBP2-208	ENST00000476817	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.44	■■□□□ 1.98
CTBP2-208	ENST00000476817	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.44	■■□□□ 1.98
CTBP2-208	ENST00000476817	HLF	Q16534	295 aa		27.43	■■□□□ 1.98

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